El principal órgano de dirección es el Consejo de Cátedra, que debe velar por el cumplimiento de los fines y objetivos de la Cátedra, impulsar y aprobar los programas de actuación, aprobar la memoria anual de actividades, proponer al Director de la Cátedra, etc.
La composición del Consejo de Cátedra es paritaria, con dos miembros nombrados por la Empresa Municipal de Aguas de Huelva y dos miembros nombrados por la Universidad de Huelva, excluido de este cómputo el/la Director/a de la Cátedra, que pertenece al mismo con voz, pero sin voto. En la actualidad el Consejo de la Cátedra está constituido por:
- Dña. Isabel Mª Rodríguez García, Vicerrectora de Innovación y Empleabilidad, por delegación de Mª Antonia Peña Guerrero, Rectora de la Universidad de Huelva
- D. Francisco José Barba Ramos, Director de Empleo, Emprendimiento y Cátedras Externas de la Universidad de Huelv
- D. Pedro Peña Chacón, Director Gerente de la Empresa Municipal de Aguas de Huelva
- Dña. Natividad Moya Sánchez, Directora de Sostenibilidad, Acción Social e Innovación de la empresa municipal de Aguas de Huelva
- D. Manuel Olías Álvarez, Director de la Cátedra