Con el objeto de responder a la necesidad de potenciar los estudios de doctorado en Física Nuclear a nivel del Estado, optimizando, al mismo tiempo, los esfuerzos docentes desarrollados en esta disciplina en las diferentes Universidades del país y favoreciendo el intercambio científico, tanto de estudiantes como de profesores e investigadores, el grupo especializado de Física Nuclear de la Sociedad Española de Física (GEFN) articuló en el curso académico 1998/99 un conjunto de cursos de doctorado que abarcaban todos aquellos aspectos básicos para la iniciación y formación en dicha disciplina.
Promovido inicialmente por los grupos de Física Nuclear de las Universidades Autónoma de Madrid (UAM), Complutense de Madrid (UCM), Barcelona (UB), Extremadura (UEX), Granada (UIGR), Islas Baleares (UIb), Salamanca (USAL), Sevilla (USEV) y Valencia, así como de los Institutos (C.S.I.C.) de Estructura de la Materia (IEM) de Madrid y de Física Corpuscular (IFIC) de Valencia, el mencionado conjunto de cursos de doctorado articulados bajo la denominación de "Escuela de Doctorado de Física Nuclear" (EDFN) ha sido impartido durante los bienios 1998/99-1999/00, 2000/01-2001/02 y 2001/02-2002/03, con un número medio de entre 10 y 15 alumnos por curso.
El éxito contrastado en los bienios precedentes, la experiencia adquirida y la implantación de la nueva legislación relativa a estudios de doctorado, así como de diversas reglamentaciones internas de las distintas universidades, ha motivado la transformación de la EDFN en un Programa de Doctorado Interuniversitario.
El programa que se presenta se establece mediante convenio entre las Universidades de Sevilla, Granada, Huelva, Salamanca, Extremadura y Complutense de Madrid, y con la participación adicional de investigadores de la Universidad Autónoma de Madrid, del Consejo Superior de Investigaciones Científicas de Madrid (Instituto de Estructura de la Materia) y de Valencia (Instituto de Física Corpuscular).