El transporte entre los diferentes campus de la Universidad de Huelva se pueden realizar en transporte público, tanto por la empresa municipal de transporte Emtusa con la línea 1 y 2 para llegar al Campus de El Carmen y las líneas 3 y 2 para el Campus de La Merced, como en el del Consorcio Metropolitano de Transporte de Huelva para el Campus de La Rábida.