El Programa Oficial de Doctorado en Ciencia y Tecnología Industrial y Ambiental (verificado conforme al RD 99/2011) resulta de la fusión de 6 Programas Oficiales de Doctorado verificados conforme al RD 1303/2007 impartidos anteriormente en la Universidad de Huelva.

Las líneas de investigación de este programa son:

• Análisis medioambiental, bioanálisis y biotecnología
• Biología ambiental
• Biorrefinería industrial y tecnología forestal
• Catálisis homogénea y fotoquímica orgánica
• Ciencia y tecnología del medio ambiente
• Ciencias de la Tierra
• Ingeniería de procesos y productos químicos
• Ingeniería eléctrica, electrónica, de control y robótica
• Física, matemáticas y computación