Los Grupos de Investigación del Departamento, todos ellos catalogados dentro del Plan Andaluz de Investigación (código FQM), son los siguientes:

- Análisis Agroalimentario y Medioambiental (FQM 310)

- Análisis Medioambiental (FQM 141)

- Análisis Metalómico y Medioambiental (FQM 349)

- Bioquímica y Biotecnología de Organismos Fotosintéticos (CVI 214)

- Compuestos de Coordinación y Organometálicos:
Aplicaciones en Procesos Catalíticos (FQM 275)