El Museo Pedagógico se ubica en el pabellón 6 de la Facultad de Educación, Psicología y Ciencias del Deporte.

Se puede acceder en coche hasta la misma sede de la Facultad de Educación, en el campus de El Carmen, y se puede aparcar fácilmente en las cercanías y plaza anexa al Museo.

Las líneas de autobús que dan acceso al Campus son:

• Línea 3.- Zafra -> Quintero Báez -> Higueral -> Universidad
• Línea 5.- Zafra -> Isla Chica -> Universidad -> La Orden -> Las Colonias
• Línea 8.- Zafra -> Bda Carmen -> La Orden -> Universidad -> Isla Chica

En Huelva, las distancias para ir caminando, no son demasiado grandes. Desde el centro de la ciudad hasta el Museo Pedagógico se tarda unos 30-40 minutos aproximadamente.